Debian 7

cd /home/servers && ./server.sh start /home/servers/rust rustik 127.0.0.1 28015 "xvfb-run wine rust_server.exe -batchmode -hostname Rust Server -maxplayers 50 -port 28015 -datadir rust_server_Data/ -oxidedir save/oxide"
Server started

:/home/servers# cd /home/servers && ./server.sh stop /home/servers/rust rustik 127.0.0.1 28015 "xvfb-run wine rust_server.exe -batchmode -hostname Rust Server -maxplayers 50 -port 28015 -datadir rust_server_Data/ -oxidedir save/oxide"
No screen session found.
Server stopped

:/home/servers# cd /home/servers && ./server.sh start /home/servers/rust rustik 127.0.0.1 28015 "xvfb-run wine rust_server.exe -batchmode -hostname Rust Server -maxplayers 50 -port 28015 -datadir rust_server_Data/ -oxidedir save/oxide"
Server not started

Start command:
su root -c cd /home/servers/rust; screen -U -m -d -S rustik xvfb-run wine rust_server.exe -batchmode -hostname Rust Server -maxplayers 50 -port 28015 -datadir rust_server_Data/ -oxidedir save/oxide
root@debian:/home/servers#

Сомневаюсь, что дело в панели.
Скорее всего дело в пакете xvfb-run, хотя точно не могу сказать, никогда с ним не работал.

И да, параметр -datadir для Rust имеет неправильное значение. Правильным будет любое другое, например -datadir "serverdata/"

И еще, для запуска Rust, вместо wine лучше использовать mono.